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研究人员利用古代基因组揭示了有关人类适应历史的新信息。

古代DNA，包括来自大约4.5万年的人类遗骸的样本，帮助研究人员了解了人类进化的一个以前未知的方面。

"人们普遍认为我们人类祖先的遗传学没有像其他动物那样因环境压力而发生变化，因为我们的沟通能力和制造及使用工具的能力增强了，

然而，通过比较现代基因组和古代DNA，研究人员发现了50多个最初罕见的有益基因变体在古代人类群体的所有成员中变得普遍的案例。

与许多其他物种相比，这种类型的适应性遗传变化的证据在人类中是不一致的。

因此，这一发现挑战了关于人类适应性的主流观点，使我们对人类如何适应他们在地球上传播时遇到的新环境压力有了新的和令人兴奋的认识。

共同牵头人、阿德莱德大学兼职研究员和澳大利亚国立大学DECRA研究员雷-托布勒博士说，检查古代DNA对于揭示人类进化的秘密至关重要。

我们相信人类群体之间的历史性混合事件可能隐藏了现代人类基因组中的遗传变化迹象。

我们检查了来自1000多个古代基因组的DNA，其中最古老的基因组大约有45000年的历史，以了解某些类型的遗传适应在我们的历史上是否比现代基因组的研究更常见。

Hu使用古代基因组是至关重要的，因为它们在重大的历史混合事件之前，这些事件从根本上重塑了现代欧洲人的遗传血统。

这使得我们能够恢复现代基因组的标准分析所看不到的历史性适应迹象。

在23份3.0-4.5万年的，共测得20个古代父系，其中C系为10个，占据一半。

我们完全可以说，古代C是欧亚大陆的王者，今天欧亚大陆各地都有4万年的古老C1的后代，遍布欧洲的C-V20（普遍在1-2%左右）、日本人的C-M8、中国华南特有的的C-F1640、澳大利亚和新几内亚的C-M38、阿拉伯半岛特有的C-P92、印度半岛特有的K96，都是4.88-4.72万年前古老的人群C1的后代，可以看出C1在4万年去应该是遍布在整个欧亚大陆的。

C1和我们中国和蒙古较多的C2，分化于6.59-4.88万年前，今天C2的数量远远多于C1，其C2的原始起源地应该是在中国北方和蒙古地区，在距今4000年后才开始扩散。

欧洲古老的旧石器时代的猎人——克罗马农人，其父系的主体就是C1a2-V20，其次有少量古老的I。

D的分化

由于缺少年代古老的D类型的古代DNA，仅仅从现代D的分布推测，文章认为现代D类型应该也是起源于亚洲东部的，从分化树可以看出，D的分化年代大概6.52-4.65万年前。

D和E是共祖的，他们和C和F的祖先CF在6.85-6.52年前的某个时点分化。

以下为古代DNA数据（仅选取超过30000年的数据，其中并没有D被发现，大部分古代数据都是C类型）

F的演化

F类型是现代人中最多的，其最古老的分叉，都在东亚地区被发现，包括F2a和F2b等，分化时间大致在6.59-4.88万年前，其中F2a是以五个拉祜族个体为代表的。

the five Lahu samples (HGDP01317, HGDP01318, HGDP01320, HGDP01321 and HGDP01322)

F类型的古代人类，与尼安德特人发生混血，今天F人群的后代，都带有尼安德特人成分。

（1-2%），by mixture with Neanderthals contributing ~ 2% to all non-Africans。

4.85-4.72万年前，K从F人群中分化出来，已知的K人群古老的DNA包括距今4.5万西伯利亚的Ust'-Ishim（乌斯太-伊希姆）的K-M2308和距今3.9万年前的中国的北京田园洞古人K-M1205，从这个分布可以看出，古老的K类型，其分化地点应该是在亚洲大陆的北部地区，从中国北方直至西伯利亚南部，现代人类数量最多的几个类型，包括R、O等等，应该都是4.8万年前从中国北方起源的，今天占欧洲各地人口40-90%的R类型，其父系原始起源地都在中国北方到西伯利亚南部的广大地区。

对现代人类的数据分析

文章选取了海量现代人数据，包括the Simons Genome persity Project (SGDP) (Mallick et al. 2016)、the Human Genome persity Project (HGDP) (Bergstrom et al. 2020）、并从著名的千人库里选取了50个全覆盖个体the 1000 Genomes Project dataset (Poznik et al. 2016)，从西藏、安达曼、新加坡马来等库中选取了C、D、F等早期分叉数据。

从现代人数据分析中，也结论支持CDF等古老人群的亚洲东南部起源。

对于人类迁徙历史的回顾和展望

对于人类早期的迁徙历史，我们应该用开放的眼光认真对待。

早期人类的迁徙和混血是非常频繁的。

距今20-6万年的，所有的人类都生活在非洲，在6万年前，一支古老的人群离开非洲，他们在约5万年前先后与两种非智人（尼安德特人和丹尼索瓦人）发生融合，然后一支迁徙到了东南亚地区的成为F人群，这个事情，除了东亚南部的F类型外，整个欧亚大陆分布的都是C类型。

在距今约6-5万年发生分化，F类型中的的一支向西迁徙，形成了IGH等等类型，另一支向北迁徙，在中国北部4.5万年前成为K人群，K人群在中国北方分化出K2a和K2b，这些新人群的发展逐渐排挤和稀释了原有的C和D人群，现代D人群主要分布在高寒和海岛等地区，大陆核心区的残留C和D人群则被覆盖和稀释。

K2b人群在中国北部分化为两支，一支MS向南，形成了今天的大洋洲的M和S类型，另一支形成西伯利亚南部的P1人群，这个人群在4.4-4.1万年前，分为Q和R人群，Q人群在距今1万年前进入美洲，形成印第安人，R人群从南西伯利亚和东欧，在距今4000-5000年前，迁入欧洲并取代大部分当地父系（I、J、G、E和C1a2）。

K2a人群与我们关系更为密切，K-M2308的Ust'-Ishim古人的下游是K-M2335，其在距今4.15-3.68万年前，分化形成NO类型，其中在3.68-3.05万年前形成O类型，其中O类型是今天中国、东亚其他地区、东南亚的主流类型，古代DNA数据表明，这一类型在7000-5000年前是华南地区的主要类型。

O的兄弟类型是N类型，这一类型，曾经广泛分布在中国北方，在距今9000-5000年前，N类型华北地区的主要人群，包括扁扁洞文化、小荆山文化、大汶口文化、仰韶人口的一部分、红山文化，夏家店文化，直到距今5000年前，O类型逐渐从华南北上为止。

N类型的一支，在距今8000年前从中国华北出发，先进入西伯利亚，然后进入东欧和北欧，是今天大约60%的北欧芬兰人，5%的瑞典等日耳曼人，20%的俄罗斯人、1%的英国人的祖先。

作者：夜里煮酒叹心愁 https://www.bilibili.com/read/cv14625564 出处：bilibili

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